ACTIVIDAD DE INVESTIGACIÓN: EL GENOMA HUMANO


Objetivo: Localizar secuencias de DNA humano, usando las bases de datos del Proyecto Hugo.

Orientaciones y recursos:

Entra en esta página de Human Genome Resources.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human/

Verás a la izquierda las siluetas de los 24 cromosomas diferentes de la especie humana (22 autosomas más los dos cromosomas sexuales). Si pulsas sobre la silueta de algún cromosoma puedes ver su mapa de genes, mapa físico, etc. En la parte superior tienes otra ventana de búsqueda ("Search") en la que puedes buscar, por ejemplo, nombres completos de genes, enfermedades, etc., localizando bancos de genes, mapas, publicaciones al respecto, etc.

Por ejemplo, si escribes la palabra "cancer" (sin las comillas), a la vez que seleccionas en la ventana de la izquierda "LocusLink", y le das a "Go", llegarás a unas pantallas en las que encontrarás referencias de todos los loci conocidos de genes relacionados de alguna manera con el cáncer. La cantidad de información que aparece en cada pantalla es enorme, incluyendo numeración, identificación, descripción y, a la derecha, en letras de colores, puedes ver artículos referentes al locus, secuencias, genes relacionados, etc. A la derecha de la columna de descripción aparece un código que indica la posición del locus en un cromosoma, algo así como:

2q24, 4q22


que indica en qué cromosoma se encuentra el locus (cromosoma 2, cromosoma 4), en qué brazo se encuentra (p, q) y la distancia desde el centrómero (24, 22). Si pulsas en alguno de estos códigos entrarás en una nueva página en la que verás un mapa del cromosoma en cuestión con la localización de ese locus.

La información que se puede encontrar es sencillamente interminable. Puedes entretenerte cambiando tu búsqueda, poniendo otros nombres de enfermedades (eso sí, en inglés). Vamos a hacer un pequeño ejercicio para manejarnos en estas bases de datos.

Vuelve a la página inicial

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human/

y selecciona "Maps" en la ventana de búsqueda. Al lado escribe "Alzheimer". Vamos a buscar alguna información sobre esta enfermedad degenerativa del Sistema Nervioso Central. Pulsa en "Go" y verás una nueva página en la que aparecen las siluetas de los 24 cromosomas con unas marcas de color rojo que indican dónde hay genes relacionados con la enfermedad de Alzheimer. Si bajas un poco por la página aparece la referencia de los cromosomas y los locus correspondientes. Fíjate en el cromosoma 14, y a la derecha pulsa en "Genes cyto", aparecerá un mapa de una región determinada del cromosoma 14, con muchos genes diferentes, entre ellos y remarcado, el gen que buscamos (Psen1) que posee un alelo que provoca la variante más habitual de la enfermedad de Alzheimer. Retrocede a la página anterior y pulsa ahora en "Genes seq"; sale una página en la que aparece una región mucho más reducida del cromosoma 14, con el mismo gen de antes remarcado (Psen1). A su derecha hay cinco enlaces. Pulsa sobre el enlace que pone "seq" y no te preocupes si no entiendes nada de lo que pone, simplemente pulsa en la palabra "Display" que está abajo y llegaremos, por fin, a la esencia misma del gen, es decir, su SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS.