Los gametos son flagelados todos o, al menos, los masculinos. La fecundación se da siempre en el medio acuático, fuera de los gametangios, por lo que el desarrollo del zigoto es independiente del gametofito. En algas pluricelulares hay alternancia de generaciones entre el gametofito y el esporofito, incluso con alternancia de tres generaciones. Es éste un caso único en la naturaleza, que sucede en las algas rojas, en las que hay un gametofito y dos esporofitos.

La reproducción sexual la llevan a cabo los gametofitos. En ellos se desarrollan los órganos sexuales:

- ANTERIDIOS, son los órganos sexuales masculinos, en los que se formarán los ANTEROZOIDES, que son los gametos masculinos.
- ARQUEGONIOS, son los órganos femeninos, donde se formará una OOSFERA, que es el gameto femenino.

Los anteridios se abren y los anterozoides nadan hasta llegar al arquegonio, donde se producirá la fecundación. El zigoto se desarrolla dando un esporofito, cuya forma es similar a una cerilla, en el que se forman las esporas por meiosis. Al caer germinan, si las condiciones son aptas, y regenerarán un nuevo gametofito.

Es parecida a la de los musgos porque se producen los mismos órganos y gametos. Sin embargo presentan una diferencia fundamental, consistente en que el esporofito es más importante, más grande y vive más tiempo y el gametofito es mucho más pequeño y vive menos tiempo.

Los esporofitos parecen hojas (llamadas FRONDES) que salen del suelo. En su cara inferior existen unas estructuras llamadas SOROS que es donde se forman las esporas por meiosis. Las esporas caen al suelo, germinan y originan los gametofitos. En ellos se forman anteridios y arquegonios, anterozoides y oosferas y se produce la fecundación, formándose un zigoto que, al desarrollarse, dará lugar a un nuevo esporofito.

La reproducción es muy compleja. El gametofito está tan reducido que únicamente vemos los esporofitos. Para crear las esporas existen unos órganos especializados que son las FLORES.

Las flores están formadas por hojas modificadas que se disponen en el extremo de una ramita. Existen cuatro tipos de hojas:

• SÉPALOS: Son verdes y muy parecidos a hojas. Son resistentes porque su función es proteger a las otras piezas. Todos los sépalos forman el CÁLIZ.
• PÉTALOS: Suelen ser muy llamativos, de colores atractivos y olores penetrantes porque su función es atraer a los insectos polinizadores. El conjunto de pétalos de una flor se llama COROLA.
• ESTAMBRES: Constituyen la parte masculina de la flor. Son unos filamentos delgados que terminan en una bolsa donde se producirá la meiosis y se formarán las esporas, que en las plantas superiores reciben el nombre de GRANOS DE POLEN. El conjunto de estambres de una flor forma el ANDROCEO.
• CARPELOS: Son la parte femenina de la flor. En su interior hay unos órganos llamados ÓVULOS en los que se produce la fecundación. El conjunto de carpelos forma el GINECEO o PISTILO, que acaba en una punta alargada llamada ESTIGMA.

Cuando madura la flor, se forman los granos de polen en los estambres y se van liberando. Estos granos de polen son transportados (= POLINIZACIÓN) por diversos agentes (el viento, insectos, el agua, etc.) hasta que llegan al estigma de otra flor donde germinan produciendo los gametos masculinos y un tubo largo llamado TUBO POLÍNICO, que llega hasta el óvulo. Los gametos masculinos bajan por el tubo polínico hasta llegar a los gametos femeninos que están en los óvulos, originándose entonces la fecundación.

El resultado de la fecundación es un embrión que queda rodeado por sustancias nutritivas y por unas cubiertas o cáscaras muy resistentes (piensa por ejemplo en una almendra o una avellana). Este conjunto de embrión, nutrientes y cáscaras constituye una SEMILLA, que puede aguantar mucho tiempo sin germinar.

Por último, en las plantas más evolucionadas, los carpelos se transforman para dar el FRUTO, que sirve para proteger a las semillas y para ayudar a que sean transportadas a otros lugares..

Las semillas diseminadas por muchos lugares pueden germinar si las condiciones son favorables y dar lugar a nuevos esporofitos.